凹凸世界的创世神是一位很肆意随性的神明，他创造了凹凸世界的无数星球和人民，又随心所欲地统治着他们。同时他还设立了七神使，让他们代行神旨。

在午夜神秘的钢琴声中凹凸学园的新学期开学了。教师团队对校园中发生的神秘事件含糊其辞，而一个个谜题却总出现在同学们的身边。洒满阳光的美术教室弥漫着浓雾、破旧的老教学楼散发着诱人的香气……幕后主使竟拥有关闭校园的权利！同学们，凹凸学园解谜大事件欢迎加入！